第一战区（辖区：河南、安徽两省北部，共12个步兵师1个步兵旅1个骑兵师1个骑兵旅。）
司令长官：卫立煌
第二集团军 总司令 孙连仲；
第三集团军 总司令 孙桐萱；
豫北自卫军 总司令 朱怀冰
第二战区（辖区：山西全部、陕西东北部，共32个步兵师14个步兵旅5个骑兵师3个骑兵旅。）
司令长官：阎锡山
第十四集团军 总司令 卫立煌（代）；
第四集团军 总司令 孙蔚如；
第五集团军 总司令 曾万钟；
第六集团军 总司令 杨爱源；
第七集团军 总司令 赵承绶；
第八集团军 总司令 孙楚；
第十三集团军 总司令 王靖国；
第十八集团军 总司令 朱德；
晋陕绥边区军 总司令 邓宝珊；
战区直辖部队 总司令 张励生
第三战区（辖区：浙江、福建全部，江苏、安徽南部，共22个步兵师2个步兵旅）
司令长官：顾祝同
闽绥靖区兼第二十五集团军 主任兼总司令 陈仪；
第十集团军 总司令 刘建绪；
第三十二集团军 总司令 上官云相；
第二十三集团军 总司令 唐式遵；
第四战区（辖区：广东、广西全部，共18个步兵师2个步兵旅。）
司令长官：蒋中正（兼），张发奎（代）
第十六集团军 总司令 夏威；
第十二集团军 总司令 余汉谋；
第五战区（辖区：安徽西部、湖北北部、河南南部，共28个步兵师1个骑兵师1个骑兵旅。）
司令长官：李宗仁
第十一集团军 总司令 李品仙；
第二十二集团军 总司令 孙震；
第二十九集团军 总司令 王缵绪；
第三十三集团军 总司令 张自忠；
长江上游江防司令部 司令 郭忏；
战区直辖部队
第八战区（辖区：绥远、宁夏、甘肃、青海，共6个步兵师9个步兵旅4个骑兵师4个骑兵旅。）
司令长官：朱绍良
第十七集团军 总司令 马鸿逵；
傅作义部队 总司令 傅作义；
东路部队 总指挥 鲁大昌；
第九战区（辖区：湖北南部、江西西部、湖南全部，共52个步兵师。）
司令长官：陈诚
第一集团军 总司令 卢汉；
第九集团军 总司令 吴奇伟；
第十九集团军 总司令 罗卓英；
第二十集团军 总司令 商震；
第二十七集团军 总司令 杨森；
第三十集团军 总司令 王陵基；
第三十一集团军 总司令 汤恩伯；
湘鄂赣边区游击总指挥部 总指挥 樊松甫
第十战区（辖区：陕西，共9个步兵师1个步兵旅1个骑兵师1个骑兵旅。）
司令长官：蒋鼎文
第三十四集团军 总司令 蒋鼎文（兼）；
第十六军
鲁苏战区（辖区：江苏北部、山东全部，共7个步兵师。）
总司令 于学忠
冀察战区（辖区：河北、察哈尔，共5个步兵师1个骑兵师。）
总司令 鹿钟麟
军委会直属部队：第一、五、三十一、三十六、七十一、九十九等军。
重庆卫戌总司令部 总司令 刘峙。
（注：1940年7月，战斗序列再作调整，共计268个步兵师、44个步兵旅、12个骑兵师、8个骑兵旅）
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